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Species belonging to selected taxon:

Arachis duranensis, Arachis hypogaea, Arachis ipaensis



ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST000097
species: Arachis duranensis
miRNA family: MIR398
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Arachis duranensis Arachis Dalbergieae Papilionoideae Fabaceae Fabales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 TGTGTTCTCAGGTCGCCCCTG

miRNA*
 GGGTCGTCCTGAGACCACATG

mismatches: 3
bulges: 0
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pre-miRNA
 GATCTAATAGATGTGGAGGTAGGGGTGTTCTACAGGGTCGTCCTGAGACCACATGAGGTTCAAGGGTTTCGGATTATAACAGGCAATCATATATTCTCTTG
TTCTTTTTTACTTGTGACTGTCATCAGTTGGTACATTCCTAGTTCGGTTTTAGCCATTAATCTCGATTATGTATATATTTTATGATTGAAATTAATGGCT
AAAACTATTGAAACATCAGTATTTCTAAAATACTTGAAACACTATATTTTTTATTTAAACAAACTGGTTTGTAGTTGTACCAAACAATGACGGTAACGGA
AAAAAAAACATCAGAGTATATGACTGTGGTTCGATCTGAGAGCTTACATTGCTCATATCATGTGTTCTCAGGTCGCCCCTGCGGGACTTTCTCTACTAAA
TTACGGGATTG

dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase vvi-MIR398c: 9.0E-8

PMRD vvi-miR398c: 9.0E-8

microPC miR398: 1.0E-6		UniProt no hits

RFAM 8MIR398: 2.0E-6		most similar mature miRNAs

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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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