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ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST000058
species: Aquilegia formosa x Aquilegia pubescens
miRNA family: MIR1439
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Aquilegia formosa x Aquilegia pubescens Aquilegia Ranunculaceae Ranunculales stem eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 ATTTGGGACGGAGGGAGTATG

miRNA*
 ATACTCCCTCTGTCCCAAATTA

mismatches: 0
bulges: 1
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pre-miRNA
 TATGTACAACATTGTTTATTTGATACTCCCTCTGTCCCAAATTATAAGTACCTTATTCCATTTTAGATTGTCCCAAAATATATGTCGCTTTTGACTTTTC
AACACATATTAATTAAGTTAAATGGTTCATTTGTCTATACTATCCTTGCTTTAAGATTAGAGTAATTATTCTAATGAAAAGTTAGACATTGTAATTAGTA
TTAAATAGGGGTAAATTAGAAAATAGAATTAGTAGACAAACAATAAATGATGTTTCCTTAATAAATAGAATATTCTAAAAGGTACTTATAATTTGGGACG
GAGGGAGTATGAACAAACAGTATCTTTATT

dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase no hits

PMRD osa-miRf11090-akr: 0.00007

microPC miR1439: 0.00007		UniProt no hits

RFAM MIR1122: 0.000005		most similar mature miRNAs

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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
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