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ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST000097
species: Arachis duranensis
miRNA family: MIR398
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Arachis duranensis Arachis Dalbergieae Papilionoideae Fabaceae Fabales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 TGTGTTCTCAGGTCGCCCCTG

miRNA*
 GGGTCGTCCTGAGACCACATG

mismatches: 3
bulges: 0
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pre-miRNA
 ATCTAATAGATGTGGAGGTAGGGGTGTTCTACAGGGTCGTCCTGAGACCACATGAGGTTCAAGGGTTTCGGATTATAACAGGCAATCATATATTCTCTTG
TTCTTTTTTACTTGTGACTGTCATCAGTTGGTACATTCCTAGTTCGGTTTTAGCCATTAATCTCGATTATGTATATATTTTATGATTGAAATTAATGGCT
AAAACTATTGAAACATCAGTATTTCTAAAATACTTGAAACACTATATTTTTTATTTAAACAAACTGGTTTGTAGTTGTACCAAACAATGACGGTAACGGA
AAAAAAAACATCAGAGTATATGACTGTGGTTCGATCTGAGAGCTTACATTGCTCATATCATGTGTTCTCAGGTCGCCCCTGCGGGACTTTCTCTACTAAA
TTACGGGATTG

dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase vvi-MIR398c: 0.00000009

PMRD vvi-miR398c: 0.00000009

microPC miR398: 0.000001		UniProt no hits

RFAM MIR398: 0.000002		most similar mature miRNAs

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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
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