ABOUT THIS RECORDspecies: Arachis duranensis
miRNA family: MIR414
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Arachis duranensis Arachis Dalbergieae Papilionoideae Fabaceae Fabales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TCATCATCATCATCATCTTTC miRNA* AGGGAGTGGCGGAGGTGGAT mismatches: 3 bulges: 1 |
pre-miRNA
GTACGGAGGAGAAGGGAGTGGCGGAGGTGGATCAAGCGGCGGGAGCTATACTACTTCAGGGCAGGGTTATGGTGTGAATTATCCGCCTCATCAACTGTTT
CAGTATTCTCCGATTGCTTCAACCGGTGGCTATGCTCAGCACTATGCAACTCCCATGTCCCTTGCTCCTTCCCCTGCCTTGCAATCAGTGTGTTTTGCTG
TGCCGCAGGCGTGACAATGGCTCTTCAAGCTCCAATTCCTCACCGCTAGAGACTTATAAAATGAAACACTAAGCTATGTCATCCCATCATCATCACTTAT
TGCATGCATGCTTCTTCAAGTCTCTCATCATCATCATCATCATCTTTCTACCTTTTG
dot-bracket secondary structure
....((((((((((((.((((.((.(((((.....((((((..(((.((((.(((.((((((((((..(((((((((..((.(((((.........(((.
.((((.((...)).))))..))).))))).))...))).))))))((((............))))......)))))))))).....)))))))...))).
)))))).(((((((.(((((((.....))))...)))..))).))))((((((((.......(((.((....((.((((.((................))
.)))))).)).)))...))))))))..))))).)).))))..))))))).)))))..
SIMILARITIES
MORE
miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
Source sequences
download this record
GTACGGAGGAGAAGGGAGTGGCGGAGGTGGATCAAGCGGCGGGAGCTATACTACTTCAGGGCAGGGTTATGGTGTGAATTATCCGCCTCATCAACTGTTT
CAGTATTCTCCGATTGCTTCAACCGGTGGCTATGCTCAGCACTATGCAACTCCCATGTCCCTTGCTCCTTCCCCTGCCTTGCAATCAGTGTGTTTTGCTG
TGCCGCAGGCGTGACAATGGCTCTTCAAGCTCCAATTCCTCACCGCTAGAGACTTATAAAATGAAACACTAAGCTATGTCATCCCATCATCATCACTTAT
TGCATGCATGCTTCTTCAAGTCTCTCATCATCATCATCATCATCTTTCTACCTTTTG
dot-bracket secondary structure
....((((((((((((.((((.((.(((((.....((((((..(((.((((.(((.((((((((((..(((((((((..((.(((((.........(((.
.((((.((...)).))))..))).))))).))...))).))))))((((............))))......)))))))))).....)))))))...))).
)))))).(((((((.(((((((.....))))...)))..))).))))((((((((.......(((.((....((.((((.((................))
.)))))).)).)))...))))))))..))))).)).))))..))))))).)))))..
SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
MOREmiRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
Source sequences
download this record
