ABOUT THIS RECORDspecies: Avena barbata
miRNA family: MIR414
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Avena barbata Avena Aveninae Poeae Pooideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TCATCATCATCATCATCCTCA miRNA* AGGCTGTCGATGATGGTGGTC mismatches: 4 bulges: 0 |
pre-miRNA
TCATCATCATCGTCACCATCATCATCATCATCATCATCCTCATCCTCATCCTCCTCCTCCATAATTGATGATTCGAAACGCGCCCAAGCACCGTCTAAAT
ATAGTTCTTGAGTGAGCGACGTGTTTCTCTTCTTCTTCCTGGTCACTATCTCGATGTCAGGAACATGAAGTAGATGTATATCGTTACATTAAAAAGAACA
GAATGATCCTACTGCACTTGTGGATGGGGGGAGACGGAGTGGAGGTGGAGGTGGAGTCAGAGGCTGTCGATGATGGTGGTCGAAGTATGGTGACAAAAC
dot-bracket secondary structure
...........(((((((((((((((((((((..((.((((...(((..(((((.(((((((..((((....))))...((......)).((((((...(
((.((((((.(((((((((.((((.(((((((...(((((((((........))..)))))))...)))).))).)))).))))).))))...)))))).
..))).(((((((((....)))).)))))..)))))).))))))).)))))..)))...)))).))..)))))))))))).))....))))))).....
SIMILARITIES
MORE
miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
download this record
TCATCATCATCGTCACCATCATCATCATCATCATCATCCTCATCCTCATCCTCCTCCTCCATAATTGATGATTCGAAACGCGCCCAAGCACCGTCTAAAT
ATAGTTCTTGAGTGAGCGACGTGTTTCTCTTCTTCTTCCTGGTCACTATCTCGATGTCAGGAACATGAAGTAGATGTATATCGTTACATTAAAAAGAACA
GAATGATCCTACTGCACTTGTGGATGGGGGGAGACGGAGTGGAGGTGGAGGTGGAGTCAGAGGCTGTCGATGATGGTGGTCGAAGTATGGTGACAAAAC
dot-bracket secondary structure
...........(((((((((((((((((((((..((.((((...(((..(((((.(((((((..((((....))))...((......)).((((((...(
((.((((((.(((((((((.((((.(((((((...(((((((((........))..)))))))...)))).))).)))).))))).))))...)))))).
..))).(((((((((....)))).)))))..)))))).))))))).)))))..)))...)))).))..)))))))))))).))....))))))).....
SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
MOREmiRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
download this record
