ABOUT THIS RECORDspecies: Brassica napus
miRNA family: MIR319
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Brassica napus Brassica Brassicaceae Brassicales malvids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTGGACTGAAGGGAGCTCCTT miRNA* GGAGATTCTTTCAGTCCAGTC mismatches: 1 bulges: 0 |
pre-miRNA
GAAGCGAGACTGAAATAGATAGATATAGAAGGAGATTCTTTCAGTCCAGTCATGGATAGAACAAGAAGAGGGTAGAAACATCTGCCGACTCATCCATCCA
AACACTTCTGGTAAAAAGAAAAGAGATTTTATACCACAGTGGCTGTGTGAATGATGCGGGAGATGTTTTCATCTCTCTTTATCTGTGTTTGGACTGAAGG
GAGCTCCTTCTTAATTTACATGTTTCAAATTTTCTC
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase aly-MIR319d: 2e-59 PMRD ath-miR319c: 2e-56 microPC miR319: 0.00000005 | UniProt no hits RFAM MIR159: 2e-103 | most similar mature miRNAs |
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