ABOUT THIS RECORDspecies: Brassica napus
miRNA family: MIR319
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Brassica napus Brassica Brassicaceae Brassicales malvids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTGGACTGAAGGGAGCTCCTT miRNA* AGAGCTTTCTTTGGTCCACTC mismatches: 2 bulges: 0 |
pre-miRNA
AAAAATTAATGGGCTTAGGGATGATGGGTTGGTGGAGGAAGAGAGCTTTCTTTGGTCCACTCATGGAGTAATATGTGAGATTTAATTGACTCTCGACTCA
TCCATCCACATACCAAATGAAAGAATATGTTCCCATATGGTAAATGAATGAATGATTCTAGAGACAAATTGAATCTTTACTTCTCTATGCTTGGACTGAA
GGGAGCTCCTTTCCTTTGTTTTCCAATATTTCTACATCTCATTATATTT
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase aly-MIR319b: 1e-76 PMRD ath-miR319b: 7e-72 microPC miR319: 1e-67 | UniProt no hits RFAM MIR159: 6e-76 | most similar mature miRNAs |
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