ABOUT THIS RECORDspecies: Brassica napus
miRNA family: MIR159
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Brassica napus Brassica Brassicaceae Brassicales malvids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTTGGATTGAAGGGAGCTCTA miRNA* GGGCTCCTTATAGTTCAAACG mismatches: 1 bulges: 0 |
pre-miRNA
GAACAAAGAAGTAGGGCTCCTTATAGTTCAAACGAGAGTTCAGCAGGGTAAAGAAAAGCTGCTAAGCTATGAATCCCATAAGCCCTAATCCTTATTTATA
AAAAGGATTTGGTTATATGGCTTACATATCTCAGGAGCTTTAACTTGCCCTTTAATTGCTTTTACTCTTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTACATCTTCTT
T
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase bra-MIR159a: 1e-97 PMRD bra-miR159a: 1e-97 microPC miR159: 2e-99 | UniProt no hits RFAM MIR159: 4e-70 | most similar mature miRNAs |
Identical with: miR159 from microPC (MNEST045445) |
MOREmiRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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