ABOUT THIS RECORDspecies: Citrus sinensis
miRNA family: miR1515
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Citrus sinensis Citrus Rutaceae Sapindales malvids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TCATTTTTGCGTGCAATGATCC miRNA* ATCATTCACGCAAAAATGATT mismatches: 0 bulges: 1 |
pre-miRNA
GGAAGGTGCTGGTTGCTTCACAATTCCAACTCGTCGATTTGCATCATTTTTGCGTGCAATGATCCCGAATTTGCTCTCTTACTCAACTTTCTTTTTAATT
TACAAATATTCATGTTTATTGGTTTGAAAAATAGAAAAAAAAATTCTAATTTTTGTTAACGGGGATCTGGATCATTCACGCAAAAATGATTTGACTCGTG
AGTTGGCCTTGTGAAGAGACCAGTGCTATCA
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase csi-MIR1515: 2e-75 PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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