ABOUT THIS RECORDspecies: Citrus sinensis
miRNA family: MIR1533
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Citrus sinensis Citrus Rutaceae Sapindales malvids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTAATAAAAATAATAATGAAA miRNA* TCGTTATTTTATTTTCTTGTTC mismatches: 4 bulges: 1 |
pre-miRNA
CTCAATATTAAACTTTACCCTTTCGTTATTTTATTTTCTTGTTCAGTTTAATTCCATTTCCAATAAATTTTCCTAAATTTATATGGAGCATTGTATGTAT
GGGGCCTAATATGGCATAATAGAAAAGGGGGGTTTTGGCGGAATTCTTTTTAACTTATTCTTTTTAATTTTAACTTTCCCTCGTTGCTTTGCCCATCCTC
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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