ABOUT THIS RECORDspecies: Citrus sinensis
miRNA family: MIR159
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Citrus sinensis Citrus Rutaceae Sapindales malvids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTTGGATTGAAGGGAGCTCTA miRNA* GAGCTCCTTGAAGTCCAAAAG mismatches: 2 bulges: 0 |
pre-miRNA
GGGTTAAGGAGTGGAGCTCCTTGAAGTCCAAAAGAGGTTCTAGCAAGGGTAAATTGAGCTGCTGAGCTATGGATCCCACAGTCCTATGTATCAGATTTTA
GGGTTTGTTTCTGATGATGGTGATGATAGGCTTGTGGCTTGCATATTTCTGGAGCTTCATTACCCCTTAAGTTTTACCCTTTTTTGGATTGAAGGGAGCT
CTACCTCTCTACA
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase csi-MIR159: 2e-106 PMRD ptc-miRf10271-akr: 5e-17 microPC miR159: 4e-104 | UniProt no hits RFAM MIR159: 2e-20 | most similar mature miRNAs |
Identical with: miR319 from microPC (MNEST045402) |
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