ABOUT THIS RECORDspecies: Citrus x limonia
miRNA family: MIR482
source: miRNEST
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TCTTCCCTACTCCACCCATGC miRNA* ATGGGTGAGTAGGGAAGATA mismatches: 0 bulges: 1 |
pre-miRNA
GCAAATGGGGAGTAATGGAGACGGAGTTGAAGGATATTGGGAAGGTTTTGGTATGGGTGAGTAGGGAAGATAATTTAACTAAGTAATAATAATATCACAT
TTTATGTTATTACTATTTGCTTAAGGAATTTGTATATCTTCCCTACTCCACCCATGCCATAGGTTTCCCATTATTCCTCCCTCTCCTTATCTCACCTCTG
TTCCAA
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase ptc-MIR472a: 0.0006 PMRD ptc-miR472a: 0.0006 microPC miR482: 2e-53 | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
Identical with: miR482 from microPC (MNEST046554) |
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