ABOUT THIS RECORDspecies: Cucumis melo subsp. melo
miRNA family: MIR168
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Cucumis melo subsp. melo Cucumis melo Cucumis Cucurbitaceae Cucurbitales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAA miRNA* CCCGCCTTGCATCAACTGAAT mismatches: 3 bulges: 0 |
pre-miRNA
GGCTTCTTTTTGGTTCAGTCATCGGCGGTCTCTAATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACTGTTTCGCTTTTTGTTCACGTTGATCTTGATTGTTGTTGTTTC
TTTCAATTTCCTCTGCGTTGTTCAGGGGAAATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTAATCGAGCGAATTGGATCCCGCCTTGCATCAACTGAATCCGAGACA
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dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase crt-MIR168: 1.0E-14 PMRD rco-miR168: 8.0E-16 microPC miR168: 5.0E-54 | UniProt no hits RFAM 8MIR168: 2.0E-14 | most similar mature miRNAs |
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