ABOUT THIS RECORDspecies: Cynara scolymus
miRNA family: MIR167
source: miRNEST
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TGAAGCTGCCAGCATGATCTG miRNA* GGTCATCTTGCAGCTTCAAT mismatches: 1 bulges: 1 |
pre-miRNA
ATATATGTTGGTCTGAGAGATTGAAGCTGCCAGCATGATCTGGTGTTGTCAAAAAGTCACCTCTGTGTGTGTGTGTTTGTGTTTGTGTGTGTATATATTG
GAAGGATTAAGTGAGGTCAATTAATCTTTCTGCGTGTTTTTGAGGTGTTTATTAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTTATGAGTAGGGTAAGAGAG
CTTAACCAGGTCATCTTGCAGCTTCAATCACTCGTACCCAACAGTT
dot-bracket secondary structure
.....(((((((.((((.((((((((((((.((.((((((((((....(((((((..(((....(((((((....................))))))).(
((((((((((.((....)).)))))))))))..))))))))))(((.((((((.....................................))))))...)
))..)))))))))))).)))))))))))).)))).).))))))...
SIMILARITIES
MORE
miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
download this record
ATATATGTTGGTCTGAGAGATTGAAGCTGCCAGCATGATCTGGTGTTGTCAAAAAGTCACCTCTGTGTGTGTGTGTTTGTGTTTGTGTGTGTATATATTG
GAAGGATTAAGTGAGGTCAATTAATCTTTCTGCGTGTTTTTGAGGTGTTTATTAGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTTTATGAGTAGGGTAAGAGAG
CTTAACCAGGTCATCTTGCAGCTTCAATCACTCGTACCCAACAGTT
dot-bracket secondary structure
.....(((((((.((((.((((((((((((.((.((((((((((....(((((((..(((....(((((((....................))))))).(
((((((((((.((....)).)))))))))))..))))))))))(((.((((((.....................................))))))...)
))..)))))))))))).)))))))))))).)))).).))))))...
SIMILARITIES| miRBase csi-MIR167c: 0.0000000002 PMRD gma-miR167o: 0.0000000008 microPC miR167: 0.000003 | UniProt no hits RFAM MIR167_1: 0.000000001 | most similar mature miRNAs |
MOREmiRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
download this record
