ABOUT THIS RECORDspecies: Cynara scolymus
miRNA family: MIR394
source: miRNEST
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA AGGTGGGCATACTGCCAGTGG miRNA* TTGGCATTCTGTCCACCTCC mismatches: 3 bulges: 1 |
pre-miRNA
TCATGGTGGTTTAATAAAGGGTTTCTCACAGAGTTCCTTGGCATTCTGTCCACCTCCCCTTTTCTTTTTTATCAAAACCCACAACTGTAGTAGGAAAAAG
GTGAGAGGGAAGAGTTTTTCTGTGGGTGTAATTAGGGCGTGGATGTAGTTTGGAGTAGAAAAGAAAAATAAGATAGAGAAGGTGGTTTTTTTTCTGAAAA
TTGATGTAGGGTGGAGGTGGGCATACTGCCAGTGGAGCTCTGTTGGTATCTCTTTGTAAAACCCTTTTG
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase ptc-MIR394b: 0.00000000000002 PMRD ptc-miRf10096-akr: 0.0000000009 microPC miR394: 0.0002 | UniProt no hits RFAM MIR394: 0.00000007 | most similar mature miRNAs |
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