miRNEST 2.0: an integrative microRNA resource miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: Browse



ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST000525
species: Cynodon dactylon
miRNA family: MIRf905
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Cynodon dactylon Cynodon Eleusininae Cynodonteae Chloridoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 ACCTGTCATATCGAATGTTTA

miRNA*
 AAGATTTGATCTGACAGCACT

mismatches: 4
bulges: 0
View larger
pre-miRNA
 TTCCTCCCCGTTAAATTTTAGACCTGTCATATCGAATGTTTAGATACTAATTAGACGTACTAAATATAGATTAATGATAAAACCCATTCCATAACCCTAG
CGTTAAATGACGAGACGAATTTTTTAAGCCTAATTAGACTATGATTAGATAATGTGGTGCTACAGTAAACATCTTCTAATGATAGCTTAATTAGGCTTAA
TAGAATCGTCTTGCGAATTACTATCCAACTATGTAATTATTTTTGTATTTAATTTATGTTTAATTATACTATTTAGCAAATAAAGATTTGATCTGACAGC
ACTAAATTTTAGCCCCAAAGA

dot-bracket secondary structure
.........((((((.(((((..((((((.(((((((.((((....((((.(((......((((((((((((((..((((((..((((...((((.....
.)))))))).((((((((.(((.((((((((((((((.((((.((((((..((((..(((....))).))))..)))))).)))).))))))))))))))
.))).))))))))..((((((...........))))))..))))))..))))))))))))))......))).))))....)))).))))))).)))))).
.))))).))))))........


SIMILARITIES
miRBase osa-MIR2124a: 5e-18

PMRD osa-miRf11680-akr: 3e-16

microPC no hits		UniProt no hits

RFAM no hits		most similar mature miRNAs

MORE

miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
download this record




Liczniki na strone;