ABOUT THIS RECORDspecies: Euonymus alatus
miRNA family: MIRf606
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Euonymus alatus Euonymus Celastraceae Celastrales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA GGGTTTGGAATGCAGACAGAG miRNA* TGTTTTCATTTATCATATCCAG mismatches: 3 bulges: 2 |
pre-miRNA
CTTGATGGCAAAGCAAGATATGGCAGAACTTGGGTTTGGAATGCAGACAGAGATGGAATCCTCTGGAGAGAAGAATAATGGGAGGATTGATACCTGAAGT
TGATCAACACTAAGTTGTGCCATCATTGTTAATTATTCCCCTTCTTTCAATTTATATAGATAATAAATTCTCTATATGTTAATCCTGTTTTCATTTATCA
TATCCAGATCGGTTCACCATATTGTTGCAAGCTAT
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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TGATCAACACTAAGTTGTGCCATCATTGTTAATTATTCCCCTTCTTTCAATTTATATAGATAATAAATTCTCTATATGTTAATCCTGTTTTCATTTATCA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
MOREmiRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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