ABOUT THIS RECORDspecies: Euphorbia esula
miRNA family: MIR159
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Euphorbia esula Euphorbia Euphorbieae Euphorbioideae Euphorbiaceae Malpighiales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTTGGATTGAAGGGAGCTCTA miRNA* GAGCTCCTTGAAGTCCAAAAG mismatches: 2 bulges: 0 |
pre-miRNA
TAAGGGGTAGGGTGGAGCTCCTTGAAGTCCAAAAGAGGATTTGCAGGGTAAATCAAGCTGCTAATCTATGGATTCCACAGTCCTAACCCTAATTAATTATG
GGGGGATAGGCTTGCGGCTTGCATATGTTAGGAGCTTTTTTACCTCTTTGTTTTATCTTTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTACACTTTCTCT
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
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SIMILARITIES| miRBase ptc-MIR159c: 7.0E-13 PMRD ptc-miRf10271-akr: 7.0E-13 microPC miR159: 5.0E-94 | UniProt no hits RFAM 9MIR159: 1.0E-11 | most similar mature miRNAs |
Identical with: miR159 from microPC (MNEST044912) |
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