ABOUT THIS RECORDspecies: Euphorbia esula
miRNA family: MIR169
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Euphorbia esula Euphorbia Euphorbieae Euphorbioideae Euphorbiaceae Malpighiales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TAGCCAAGGATGACTTGCCCG miRNA* GGCAGTCTCCTTGGCTATG mismatches: 0 bulges: 2 |
pre-miRNA
GTGTTTGAAGAGAAAGCCTTGCATGAGGAGATAAAGTTGTGTTTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCCGCTCCATTATAATACAGGTTTTTTTTTTGAAAATC
CTAATTTAATCTAAACCTTTAGAGTCTGGGAGATCGAACTCCAGACCTCTCACTTTCTAATGGAGTAGAATAATCACCAGGCCAAGCCTTGGGTGGGTAT
TATAATACAGGCTTCAGTTGCAATAGATTAGAGACCTTTTTTTTATGGGCCACGGGCAGTCTCCTTGGCTATGCTGACCAACTTTTCTCTCTCTAGCAAG
GCTCCATCTCTTCTG
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase ptc-MIR169v: 7.0E-11 PMRD ptc-miR169v: 7.0E-11 microPC miR169: 0.0003 | UniProt no hits RFAM 5MIR169_5: 8.0E-11 | most similar mature miRNAs |
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