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ABOUT THIS RECORD
ID:
MNEST000696
species:
Fragaria vesca
miRNA family:
MIR167
source:
miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Fragaria vesca
Fragaria
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eudicotyledons
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cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
TGAAGCTGCCAGCATGATCTG
miRNA*
GGTCATTCTTGCAGCTTCAAA
mismatches:
2
bulges:
0
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pre-miRNA
GGTTTGTTTGGTTTGAGAGCT
TGAAGCTGCCAGCATGATCTG
GTACCACTAGAGACTAAACCTAGCTAGCTTGCTGTATAAATAGATCCGGAGAAGGTTG
AGTGTTGATTTTGTGTTTATGCCATGTATGTCCGTTTTGAGGTTTAGATATAAGAACTGCATCAAATAGATCGGTAAAAGATGCAGCTTGATATAGAAAT
AGGTATTCGAAATTTAGAATAGGATCCGGTTGGTGTTGATTTTGTGCTAGCTTATGTCCGGTGGCTTCAGGTTTAGATATAAGCTAGAACGGCGAAGAGA
TCGAATAGCAGAAGATCTAGATTTATGTAATTTGGTCCATACTTTTGATGGGGGTATTTTAGTTTTTGATAGATCTTGGTTTGTTTCATGTTCTGGGAAT
TCTGGAGAAATGGTTTTGAAGTCCACGAGTTCAGTTAAAGTTAAGTCTTAGATAAGTATATAAGGTTACTCTAGCTATACCA
GGTCATTCTTGCAGCTTC
AAA
CACTCACTCACCAACAGT
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase
zma-MIR167i
:
0.0000000005
PMRD
zma-miR167i
:
0.0000000005
microPC
miR167
:
0.00003
UniProt
no hits
RFAM
MIR167_1: 0.0000000005
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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction:
true miRNA
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