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ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST000740
species: Gossypium arboreum
miRNA family: miR2864.1
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Gossypium arboreum Gossypium Malvoideae Malvaceae Malvales malvids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 TTTTGCTGGCCTTGTTTTGTT

miRNA*
 ATAGATAAGGGCAGCAGCACC

mismatches: 4
bulges: 0
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pre-miRNA
 AGCGTAGACCAAATAGATAAGGGCAGCAGCACCCTCTCTGCGCTCGTAGTTGATAGATGAGCTGTGCGCTCCCCGCTGCCACACACAGCCATGACGCGGC
TCTACCCCGAAGTGCCTGCCGCTCACCGACTTACTCCGTGCGCGCACGAAGCCCACGGTTGGCGTGAGCTCCGTTGCGTCGGCGCTGTCGTGTGTAGCAG
CGTGGCCCCTTAGTGGTGTGTCGCCTATTGGCGTACGATCGCGAAGAGTGCATACATGCGCATTAGGCCTGGCTGGTGGTGGGGTCTATGGGTGGGCGGC
GGGGGGTTATCGAGTGGGGTGGGAACGAGTGGTGATGGTAATGGTGCGTATGTCGAACTCTCGGTGGAGCGCAGAGGAGACGGCAAGGTGTGTTCTGATA
GTCTGTTTTGCTGGCCTTGTTTTGTTGTTCTGGTG

dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase no hits

PMRD no hits

microPC no hits		UniProt no hits

RFAM no hits		most similar mature miRNAs

MORE

miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
Source sequences
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