ABOUT THIS RECORDspecies: Gossypium hirsutum
miRNA family: MIR1884
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Gossypium hirsutum Gossypium Malvoideae Malvaceae Malvales malvids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA AATGTATGACGCTGTTGACTT miRNA* ATCAACGGCATCATACAAATA mismatches: 4 bulges: 0 |
pre-miRNA
CAAATACTCCCTCCGTATTTCAATGTATGACGCTGTTGACTTTTCGACCATTTGTTTTATTCAATTTTTTTGTGTAAATATAAAAATATTTATGTCATGC
TTAAAAAACATTTGATGATGAATCAAGTCACAACAAAATAAATGATAATTACATTTTTTTTAATAAGATGAATGGTTAAACGTTAGACAAAAAAAATCAA
CGGCATCATACAAATAAATATATGGAGGAAATAC
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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SIMILARITIES| miRBase osa-MIR1884b: 0.00001 PMRD osa-miR1884b: 0.00001 microPC miR1884: 9e-22 | UniProt no hits RFAM MIR812: 2e-32 | most similar mature miRNAs |
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