ABOUT THIS RECORDspecies: Helianthus tuberosus
miRNA family: MIRf677
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Helianthus tuberosus Helianthus Heliantheae Heliantheae alliance Asteroideae Asteraceae Asterales campanulids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTCATGTGTGCCAAGAATTAC miRNA* GGTTCTTAATATATTGTTG mismatches: 4 bulges: 2 |
pre-miRNA
CGGAATAAATTTTCATGTGTGCCAAGAATTACGATGACCGTATAATACACTGGTACGTGGTGTTTTGAATGAGATACATAAGACGGGTTACGTAAATGTC
ACACGTTCTGTCTTCTGCTACCTTGATTATCTTCAAAGTACTTTGTACAAGTAGATCATGCTGTTATTGTGGTTCTTAATATATTGTTGGTTCTGTA
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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