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E. wawaiensis E. lanceolatusID: MNEST000927
species: Elymus wawawaiensis x Elymus lanceolatus mixed EST library
miRNA family: MIRf341
source: miRNEST
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA CCTCCGTCCCAAAATAAGTGT miRNA* ACTTATTTTGGGGCAGAGGGA mismatches: 1 bulges: 0 |
pre-miRNA
ATAGTCATCCAACAATTAATAGAGTACTTCCTCCGTCCCAAAATAAGTGTCTCAAGCTTAGTACAACTTTGTACTAGCTCTAGTATAAAGTTGAGACACT
TATTTTGGGGCAGAGGGAGTATATGTTAGCTGATTTGACATCCC
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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ATAGTCATCCAACAATTAATAGAGTACTTCCTCCGTCCCAAAATAAGTGTCTCAAGCTTAGTACAACTTTGTACTAGCTCTAGTATAAAGTTGAGACACT
TATTTTGGGGCAGAGGGAGTATATGTTAGCTGATTTGACATCCC
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase bdi-MIR5180a: 0.00003 PMRD hpr-miR1120: 0.0000000005 microPC miR1439: 1e-29 | UniProt no hits RFAM MIR1122: 1e-26 | most similar mature miRNAs |
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