ABOUT THIS RECORDspecies: Hordeum vulgare
miRNA family: MIRf341
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Hordeum vulgare Hordeum Triticeae Pooideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA CTCCGTTCCTAAATATAAGCC miRNA* CTTATATTTAGGAACAGAGGG mismatches: 2 bulges: 0 |
pre-miRNA
GGTTGTACTACCTCCGTTCCTAAATATAAGCCTTTTTAAAGATTTCACTGGGGGACTATATATGGAGCAAAATAAGCAAATCCATACTTTAATGTATGTC
TATATACATCCGTATATAGTTTCCTAGTGAAAACTTTTAAAAGACTTATATTTAGGAACAGAGGGAGTAATTG
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase tae-MIR1122: 0.000002 PMRD osa-miRf11316-akr: 0.0000006 microPC miR1436: 0.000000000002 | UniProt no hits RFAM MIR1122: 5e-29 | most similar mature miRNAs |
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