ABOUT THIS RECORDspecies: Hordeum vulgare
miRNA family: MIR1120
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Hordeum vulgare Hordeum Triticeae Pooideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA CTCTGTAAACTTATATAAGAT miRNA* CTTAAAAAGTTTATAGAGGG mismatches: 2 bulges: 1 |
pre-miRNA
AGCGTTCTGTTCCTAGGGCTATGATATGTTTTGTTCGGATGGAAACTCTGGAAGTTATTCCCTCTGTAAACTTATATAAGATGTTTTAGGTTACTACTTT
AGTGACCTAAGATGTCTTAAAAAGTTTATAGAGGGAGTATTGATTTTACATCTCAATTGTTATGTACATGTTATTACTAGTCTGAGGACGGTT
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD tmo-miR1120: 0.000000003 microPC no hits | UniProt no hits RFAM MIR1122: 1e-20 | most similar mature miRNAs |
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