ABOUT THIS RECORDspecies: Hordeum vulgare
miRNA family: MIR1118
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Hordeum vulgare Hordeum Triticeae Pooideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA CACTACATTATGGAACGGAAG miRNA* TTCATTCTATAATGTAGTACG mismatches: 3 bulges: 0 |
pre-miRNA
GGATAGTACGTACTTCCTTCATTCTATAATGTAGTACGTCGGTGTTCTTTGAGATTTAATTTTATTCATAAATTAACCAACGTTGATGGTTGCGACGGGA
GCAAAAATTATACCCTTCAAAACCTTTTTTTGAATATGAATTCAATGATATAATTTTAAACCCTCCGCAATTGTTCTCGTTGGTTAAATTTATAATTAAA
TTTAAATTTTGAAAAACACGGACACACTACATTATGGAACGGAAGAAGTAGAATATATA
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase tae-MIR1125: 0.0008 PMRD tae-miR1125: 0.0008 microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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