ABOUT THIS RECORDspecies: Hordeum vulgare
miRNA family: MIRf341
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Hordeum vulgare Hordeum Triticeae Pooideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTCCGTTCCTAAATATAAGTC miRNA* CTTATATTTTGGAACAGAGGC mismatches: 3 bulges: 0 |
pre-miRNA
TGATGTACTCCTTCCGTTCCTAAATATAAGTCATTTTAGAGATTCCACTATGGACTACATACGGATGTATATAGACATACTGTAGAGTGTACAATCACTC
GTTTTGCTCCGTATGTTGTCCGTAGTAGAATCTCTAAAAATACTTATATTTTGGAACAGAGGCAGTAGCTG
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase tae-MIR1122: 5e-29 PMRD tae-miR1122: 5e-29 microPC miR1126: 2e-43 | UniProt no hits RFAM MIR1122: 2e-44 | most similar mature miRNAs |
Identical with: miR1126 from microPC (MNEST045049) |
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