ABOUT THIS RECORDspecies: Hordeum vulgare
miRNA family: MIR482
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Hordeum vulgare Hordeum Triticeae Pooideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA ACTACTCCCTCCGTTCCTAAA miRNA* TTGGAAGGGAGGGAGTATGTA mismatches: 4 bulges: 0 |
pre-miRNA
CCGCATGGCATGCAAGAGAGCTTGCTGTCTAACTACTCCCTCCGTTCCTAAATATAAGACTTTTTAAGATTTTATTTCAAACTACGTATGGATGTATATA
TACATATTTTAGATTGGATTCATTCATTTTGCTCTGTATGTAGTCCGTAGTAGAATCTCTAGAAAGACTTGTACTCCTCCGTCCCAAAATAAGTGAGCTA
GTACAAAGTTGTACTTAGCTCGAGACATTTATTTTGGAAGGGAGGGAGTATGTAATATGGCTGCTGTTGCTTGTAATACTAC
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase tae-MIR1122: 0.000000000001 PMRD tae-miR1122: 0.000000000001 microPC miR1439: 0.000000004 | UniProt no hits RFAM MIR1122: 8e-20 | most similar mature miRNAs |
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