ABOUT THIS RECORDspecies: Lactuca sativa
miRNA family: MIR414
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Lactuca sativa Lactuca Lactucinae Cichorieae Cichorioideae Asteraceae Asterales campanulids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TCATCCTCATCATCATCATGT miRNA* GTGGTGGAGGTGAGGATTTGA mismatches: 3 bulges: 0 |
pre-miRNA
GTGGTGGTGGGCGTGGTGGAGGTGAGGATTTGAAATGTTATGAGTGCGGTGAGCCTGGTCATTTTGCAAGAGAATGTCGCCTGAGAGTTGGGGGTCGAGG
TGGAAGGCGTCGTAGCCCTATTCCAAGGCGACGTAGGAGTCCAAGCTATGGAAGGAGGAGTTATAGTCCTCGTGGAAGAAGATCTCCGCCACCTCGTTAT
AGCATATCACCTCGCAGAGGTCGTAGCTACAGCAGATCACCACCTCCTTATCGCCGTTCAAGGCGTGATGATTCACCATATGGAAATGGAGTGTAAAGGC
TGATATGGTGCAAAAGGGTGATGTTTTTTGATGTGTTCAGCTTCTTCTTCAAACTTAGAGGTCTCTTTCATACTTTTAGTATTTACTCTTAATGACTTTC
TAATGCTTTTGTGATGAGTATAATATCATATGTTTGTGATTGGTTGCTAAACAATTTATTGTATATCTTCTTTTCATTGTGCTGTGAGAGGTTTGGTTAT
CAGCTCAACCTTCGCTCTCTACTCTCTGCATCTTAGACTACTCTTCTCTGCACATCATCATCATCATCATCCTCATCATCATCATGTTGGTGGCTT
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt sp|Q38896|GRP2B_ARATH: 0.00009 RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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