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ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST001334
species: Lactuca sativa
miRNA family: MIR414
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Lactuca sativa Lactuca Lactucinae Cichorieae Cichorioideae Asteraceae Asterales campanulids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
TCATCCTCATCATCATCATGT

miRNA*
GTGGTGGAGGTGAGGATTTGA

mismatches: 3
bulges: 0

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pre-miRNA
GTGGTGGTGGGCGTGGTGGAGGTGAGGATTTGAAATGTTATGAGTGCGGTGAGCCTGGTCATTTTGCAAGAGAATGTCGCCTGAGAGTTGGGGGTCGAGG
TGGAAGGCGTCGTAGCCCTATTCCAAGGCGACGTAGGAGTCCAAGCTATGGAAGGAGGAGTTATAGTCCTCGTGGAAGAAGATCTCCGCCACCTCGTTAT
AGCATATCACCTCGCAGAGGTCGTAGCTACAGCAGATCACCACCTCCTTATCGCCGTTCAAGGCGTGATGATTCACCATATGGAAATGGAGTGTAAAGGC
TGATATGGTGCAAAAGGGTGATGTTTTTTGATGTGTTCAGCTTCTTCTTCAAACTTAGAGGTCTCTTTCATACTTTTAGTATTTACTCTTAATGACTTTC
TAATGCTTTTGTGATGAGTATAATATCATATGTTTGTGATTGGTTGCTAAACAATTTATTGTATATCTTCTTTTCATTGTGCTGTGAGAGGTTTGGTTAT
CAGCTCAACCTTCGCTCTCTACTCTCTGCATCTTAGACTACTCTTCTCTGCACATCATCATCATCATCATCCTCATCATCATCATGTTGGTGGCTT


dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase no hits

PMRD no hits

microPC no hits
UniProt sp|Q38896|GRP2B_ARATH: 0.00009

RFAM no hits
most similar mature miRNAs

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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
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