ABOUT THIS RECORDspecies: Leymus cinereus x Leymus triticoides
miRNA family: MIR2031
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Leymus cinereus x Leymus triticoides Leymus Triticeae Pooideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA ATAAGCACCGGTGCTTAAAAA miRNA* TCTGAAGCACCCGTGCCTATTT mismatches: 4 bulges: 1 |
pre-miRNA
TGCTTAGGCCTTGTATAATGCTAGATGCTTAGAAAGATGCTTAAAAAAATAAACCGGGTTTTTCTGAAGCACCCGTGCCTATTTCTATAGGAGAGACGCC
TCATTAAGCGTCTACCCTCTACAAATAAGCACCGGTGCTTAAAAAAACACTGGTTTATTTCTTTAAGCACCTCCCCTGAGCGTCTTGCATTGTACAAGGC
CTTA
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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CTTA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD tae-miR2031: 3e-21 microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
MOREmiRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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