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ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST001363
species: Leymus cinereus x Leymus triticoides
miRNA family: miR1044-3p
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Leymus cinereus x Leymus triticoides Leymus Triticeae Pooideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
ATGTAGTGCATATTTGATTTT

miRNA*
AACCAAATATGCACCACATTG

mismatches: 2
bulges: 0

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pre-miRNA
AGAGCTGTTTATATACTACTTGTTACTCCCTCTGTTCCACAATGTAGTGCATATTTGATTTTTAATAAGTCAAACAAGTCTACGTTTGAGCAAGATTGTA
GGGAAAATATCAACATCTAAAATCCAAAACTAGTATCATTAGATTCATCATGAAGTCTATTTTCATATTTTAAATATTTACTCCCTCTGTCTCATAATAT
AAGACGTTTTTAGTAGTATTTTAGATGCTGATAGTTTATTCTATAAACTTGGTCAAACGTAGACATGTTTGACTTTCTAAAAACCAAATATGCACCACAT
TG
TGAAATGGAGGGAGTATGAAGTACCGAAACCTTTTCCT


dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase tae-MIR1130: 0.00007

PMRD tae-miR1130: 0.00007

microPC no hits
UniProt no hits

RFAM MIR1122: 0.00000002
most similar mature miRNAs

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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
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