ABOUT THIS RECORDspecies: Manihot esculenta
miRNA family: MIR159
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Manihot esculenta Manihot Manihoteae Crotonoideae Euphorbiaceae Malpighiales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTTGGATTGAAGGGAGCTCTA miRNA* GAGCTCCTTAAAGTCCAATAG mismatches: 3 bulges: 0 |
pre-miRNA
AAAAAGGGAAAAGCTAAACAGTGTGTTAGGGTTAAGAAGTGGAGCTCCTTAAAGTCCAATAGAGGATCTTGCAGGGTAGATTGAGCTGCTGAGCTATGGA
TACCACAGCCCTATCCCATAATAAAAGGGAGTTCTTTTTTTCAAGTCTTCTTGGATAGGCTTGTGGCTTGCATATCTCTGGAGCTTCATTACCTTATTAT
GTTAGATCCTTGTTTGGATTGAAGGGAGCTCTACATCTAAATCTTTCACCTCTACTGCTACTGCTGCTTCT
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase rco-MIR159: 8e-29 PMRD vvi-miR159c: 7e-23 microPC miR159: 4e-95 | UniProt no hits RFAM MIR159: 1e-27 | most similar mature miRNAs |
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