ABOUT THIS RECORDspecies: Manihot esculenta
miRNA family: MIR171
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Manihot esculenta Manihot Manihoteae Crotonoideae Euphorbiaceae Malpighiales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TGATTGAGCCGCGTCAATATC miRNA* TATTGGCGTGCCTCAATCTAA mismatches: 4 bulges: 0 |
pre-miRNA
GGTGATGGTTCAGTTGCTGGAGAGAGTGGTGCATAGGTGAAGGTATTGGCGTGCCTCAATCTAATTACATGGTTAAATGATATGTTTTAGCCAAGTACTT
TTGATTGAGCCGCGTCAATATCTCCTTCAATTAATTTCACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACTCT
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SIMILARITIES
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase vvi-MIR171b: 0.000000009 PMRD vvi-miR171b: 0.000000009 microPC miR171: 3e-39 | UniProt no hits RFAM MIR171_1: 0.00000004 | most similar mature miRNAs |
Identical with: miR171 from microPC (MNEST045662) |
MOREmiRNEST target predictions: none
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HuntMi prediction: true miRNA
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