ABOUT THIS RECORDspecies: Mimulus lewisii
miRNA family: MIR477
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Mimulus lewisii Mimulus Phrymaceae Lamiales lamiids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTCTTCTTCAAAGGCTGCTTT miRNA* TTTGCAGTCATTGAAAAAGGATA mismatches: 3 bulges: 2 |
pre-miRNA
AAAGCCGAGGATTTGCAGTCATTGAAAAAGGATAATTCAAACCTACGTATTGTTCCTTTAGATATCTGTGATGAAACTTCTATAATAAAAGCTAAAGAAG
CAGTTGAAAATGAAGTAGAAGACAATGGGTTAAACTTATTGATTAACAATGCTGGTTTGAAATTGAGTATTACTTTTGAAAAACTCAACTTTGATTCTAT
GATGGAAGCCTTCAAAACCAATGCTGTTGCTCCAAGTGTTTTGACTAGGATATTTTTCCCTTTACTGAAGGTAGCAGCTGCAAAGGAGAACCCTTCTTCA
AATTTGTCTTGTAATCGTGCTGCAGTTGTGAATATCAGTAGCATATTAGGGTCTGTTACTGCTACTCGAAATAGCACATTTTTCTATGAATATTCTTCTT
CAAAGGCTGCTTTTAATATGAT
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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