ABOUT THIS RECORDspecies: Musa ABB Group
miRNA family: MIR159
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Musa ABB Group Musa x paradisiaca Eumusa Musa Musaceae Zingiberales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTTGGATTGAAGGGAGCTCTA miRNA* GAGCTCCTTGAAGTCCAAAGA mismatches: 2 bulges: 0 |
pre-miRNA
AGGTTTGGGTTGGAGGTGGAGGTGGAGCTCCTTGAAGTCCAAAGAAGGGACTTGGATGGGTGGACACAGCTGCTGGTTTATGGATTCCACTGCCCTATTCC
ATGTTTTGAGGACAAGGTTGATGGATGGTTTGGGATAGGCTTGTGGTTTGCATAACTCAGGAGCTGCATCAGCCCAGCCTGACCCTTATTTGGATTGAAG
GGAGCTCTACATCTATCTGTGGACTTCCA
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase vvi-MIR159c: 2.0E-13 PMRD vvi-miR159c: 2.0E-13 microPC miR159: 1.0E-11 | UniProt no hits RFAM 9MIR159: 4.0E-12 | most similar mature miRNAs |
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