ABOUT THIS RECORDspecies: Ocimum basilicum
miRNA family: MIRf341
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Ocimum basilicum Ocimum Ocimeae Nepetoideae Lamiaceae Lamiales lamiids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTTATTACTCCCTCCGTCCCG miRNA* GGACGGAGGGAGTACAATTCT mismatches: 5 bulges: 0 |
pre-miRNA
AGCCCACTTTATTTATTACTCCCTCCGTCCCGCGAGAATTGTCCCAAAACTTTTAGGCGCGGGTATCAAGGAAAAAGAAAATTAGTGGTGTGAGTGGGTG
GAGGAGTGAGGTTGATGAATTCTAACCACTAAATCCTTTCCATTTTTGGTAATGGGACTAATAAATGGGAAAGACCAAAAAGGAAAGTGGGACAATTTAA
ATGGGACGGAGGGAGTACAATTCTAGAAAAAA
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase osa-MIR812h: 0.00005 PMRD osa-miRf11216-akr: 0.00005 microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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