ABOUT THIS RECORDspecies: Panicum virgatum
miRNA family: MIR2504
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Panicum virgatum Panicum Paniceae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTGACCAAGTTGATAGAAAAG miRNA* TTCTCTATAAATTTGTCCAAAT mismatches: 3 bulges: 1 |
pre-miRNA
TGAGTACTGATAAGTGGTTTGTCCTAACTCCTAAGTCAAACTGTTCTAAGTTTGACCAAGTTGATAGAAAAGATTAATAATATTTTGATTATCAAATGAG
AAGAATTAGATCCATCATGAAATATGTTTCCATAATTTACTTATTTGATGTGTTATAGTTGTTAATGGTTTTTCTCTATAAATTTGTCCAAATTTAGACT
ACTTTGACTTAGGACAAACCAAAATATCTTATATTTCATGA
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase osa-MIR437: 0.00000005 PMRD osa-miR437: 0.00000005 microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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