ABOUT THIS RECORDspecies: Panicum virgatum
miRNA family: MIRf341
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Panicum virgatum Panicum Paniceae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA ATACTCTCTCCATCCCAAAAA miRNA* TATGGGGAGGAAGAAATATAT mismatches: 4 bulges: 2 |
pre-miRNA
CGGACAGGAGGACGAAGAAATATATTTTAGATTATGGGGAGGAAGAAATATATAGGAGCATGATATCTCTCTCCTGCGTGATACTAGCTACCTTACCTAG
TACGTGTGCGGTTTTGAGCTTCAGCGAGCAGGATCTGTGCGTGCATGGTACTAACAAAAGAATGAATATATATCGTTGTTACTTGTGAGTAGAACGAGAT
TCAAGCTACTGTTCGTCATCTAATTATCTTCTCTTTTTTTCATAGAAGGTGATGATGTTATTAGTTGTTACTGTAGGAGGCTGCTACGAGCTATTTGCTT
GGCATGTTTCTTCACACGATAAAATAAATGCGCGTATATACTCGATCCGCATGATTGTTTTTTCGTCTTTATTTTTCATCTGAGCAACATGCATGACGAA
CTTAATTACACGTACCCCTGCCACTAGTTGTTAAAGGAACTGATGAGCAATTTAACAAAAAATATAAAATAGAAGAGGGAAATTTTACAACAGGGCATGC
TGTCGTCGTTCTTGTATACTCTCTCCATCCCAAAAAAAAAATGTAAATCTCAATTTTCAAGAAGT
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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