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ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST001723
species: Panicum virgatum
miRNA family: MIR812
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Panicum virgatum Panicum Paniceae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 TTGAATAAGACGAGTGGTCAA

miRNA*
 GCCCACTCGTCTTATTAAA

mismatches: 1
bulges: 2
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pre-miRNA
 AAATATCATGTACTCCCACTGTTCCAAATTATAGTTCGTTTGATTTTTTTGACTTCAAGTTTGCCCACTCGTCTTATTAAAAAATTTGATGCAAAATATC
ACTTCTTTTGTTGTGGCTTGCTTTATTAATAGAAGTTCTTCAAGATTGACTTAAATTTGACGACATTTGCACAAATTTTTTTGAATAAGACGAGTGGTCA
AACTTGGGGTCAAAAAAGTCAAACGAACTATAATTTGGAATGGAGGAAGTACTGAGGAGA

dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase osa-MIR818e: 0.0008

PMRD osa-miRf11994-akr: 0.0002

microPC miR1884: 0.0008		UniProt no hits

RFAM MIR806: 1e-36		most similar mature miRNAs

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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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