ABOUT THIS RECORDspecies: Panicum virgatum
miRNA family: MIR1439
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Panicum virgatum Panicum Paniceae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA ATTTGGGACGGAGGGAGTATA miRNA* TACTCTCTTCATCCCAAATTA mismatches: 1 bulges: 0 |
pre-miRNA
GCCAGAAATTTATACTCTCTTCATCCCAAATTATTAGTCGTTTTGGCTTTTTCTAGATGCATAGCTTTTGCTATACATCTACATATATGTTTATGTCTAG
GTGCGTAGCAAAGACAATGAATTTAGAAAAGCCAAAGCGACTAATAATTTGGGACGGAGGGAGTATATATGAATAT
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase tae-MIR1122: 0.0005 PMRD hpi-miR1122: 0.00003 microPC miR1439: 0.0005 | UniProt no hits RFAM MIR1122: 0.000000003 | most similar mature miRNAs |
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