ABOUT THIS RECORDspecies: Panicum virgatum
miRNA family: MIR1439
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Panicum virgatum Panicum Paniceae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA ATTTGGGACGGAGGGAGTAGT miRNA* GTACTCTTCCGTCCTAAATTA mismatches: 0 bulges: 2 |
pre-miRNA
TTCCTTCCCTCTACGGTCCATGGTAAGCAGATGCATTCGTACGTACTCTTCCGTCCTAAATTACTATTCGTTTTGACTTTTCTAGATACACGACTTTTGC
TATGTATTAGACATAGTATATATCTAGGTGCATATCAAAAGACATGTATCTATAAAAGCCAAAATGAATAGTAATTTGGGACGGAGGGAGTAGTATATAT
GTATACTCTACTCGCCTCGCCAATCGCCATACA
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
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SIMILARITIES| miRBase ssp-MIR1128: 0.0002 PMRD osa-miRf10179-akr: 0.0002 microPC no hits | UniProt no hits RFAM MIR1122: 0.0000000009 | most similar mature miRNAs |
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