ABOUT THIS RECORDspecies: Panicum virgatum
miRNA family: MIR169
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Panicum virgatum Panicum Paniceae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TAGCCAAGAATGACTTGCCTA miRNA* GGCAAGCATTCTGGTTAAG mismatches: 0 bulges: 2 |
pre-miRNA
GTGTTGGTGAGGGAGGGAGGCCTTACATGGTGATGAAGAGCCTATCTCCCTTAGCCAAGAATGACTTGCCTATCTCTACTATTTGGTTCATCTGGGAGCC
CTTATGATGGATGAAAGGTGGATGGGCAAGCATTCTGGTTAAGCGAGTGATTCTCTTCCACCATGCTAGGCTAACCCTCTTTCTAATCCTA
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
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SIMILARITIES| miRBase osa-MIR1430: 0.000000000003 PMRD osa-miR1430: 0.000000000003 microPC miR1430: 0.000000000003 | UniProt no hits RFAM MIR169_5: 0.0007 | most similar mature miRNAs |
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