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ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST001762
species: Panicum virgatum
miRNA family: MIR806
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Panicum virgatum Panicum Paniceae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 TTTGAATAAGACGAGCGGTCA

miRNA*
 ACTACTCGTCTAATTCAACTT

mismatches: 3
bulges: 0
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pre-miRNA
 CGATCTGACAGCGTGATGGTTGTACTGTACTCCCTCCGTCCCAAAAAGATCGTTGTTCTTTGACTCTTAAAAATTGTGTTTGACTACTCGTCTAATTCAA
CTTTTTTTTTACAAATATTATCACTTTTGTTATGACTTATTACATCACTAATGATATTTTAATAATATTTTATTTGTCTTATAATATATATAAAATATTT
GAATAAGACGAGCGGTCAAACGCAATTTCTAAGAGTCAAAGAACAACGGTTTTTTTGGGACGGAGGAAGTATGCTACTAGTACTCTGCACCGGACGA

dot-bracket secondary structure
((.((((.(((.(((.((((.((...(((((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((.(((((((((((((((.(((((((.((((((
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SIMILARITIES
miRBase tae-MIR1122: 0.001

PMRD tmo-miR1122: 0.0002

microPC miR1439: 0.00002		UniProt no hits

RFAM MIR1122: 0.000005		most similar mature miRNAs

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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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