ABOUT THIS RECORDspecies: Panicum virgatum
miRNA family: MIR319
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Panicum virgatum Panicum Paniceae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTGGACTGAAGGGTGCTCCC miRNA* GAGCTCTCTTCAGTCCACTC mismatches: 3 bulges: 0 |
pre-miRNA
CTCTGGAAGAGAGCTCTCTTCAGTCCACTCTGAAATGGCCGTAGGGTTTCATTAGCTGCCGACTCATCCATTCACCTACCAAGATCCATGGACGCGGAAT
GTCTTGGTAGCTGATTGGATGGCGCGGGAGCTAAAATTAAGCTCTACGCTGTTTGTGGTTGGACTGAAGGGTGCTCCCTTGCTCG
dot-bracket secondary structure
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CTCTGGAAGAGAGCTCTCTTCAGTCCACTCTGAAATGGCCGTAGGGTTTCATTAGCTGCCGACTCATCCATTCACCTACCAAGATCCATGGACGCGGAAT
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SIMILARITIES| miRBase zma-MIR319a: 2e-68 PMRD zma-miR319a: 2e-68 microPC miR319: 0.0000000006 | UniProt no hits RFAM MIR159: 8e-56 | most similar mature miRNAs |
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