ABOUT THIS RECORDspecies: Panicum virgatum
miRNA family: MIR437
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Panicum virgatum Panicum Paniceae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA AAAGTTAGAGAAGTTTGACTT miRNA* GTCAAGCTTCTATAAATTTGA mismatches: 2 bulges: 0 |
pre-miRNA
AAATTATAGTTTAATTTAGCTTTTGTCTAAGTCAAGCTTCTATAAATTTGACCAATTGTATAGGAAAAACCAATATTTACAACATCCAATTAGTTTTGTT
GAGTCGGCCATGAAATATGTTCTGAATTTCTGATAGTGCCTTTGTTTGGTACTATATATGTTAATATATTTTTCTAAAAAATATAGTTAAAGTTAGAGAA
GTTTGACTTAGGACAAAGCTAAAGTGAACTATAATTTGGAATGAAGGG
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase osa-MIR437: 0.0000000002 PMRD osa-miR437: 0.0000000002 microPC miR437: 0.00000001 | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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