ABOUT THIS RECORDspecies: Panicum virgatum
miRNA family: MIRf341
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Panicum virgatum Panicum Paniceae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA CATCTACTCCCTCCGTCCCTA miRNA* GGGACAGAGGGAGTAGGTCCC mismatches: 3 bulges: 0 |
pre-miRNA
TGGTGTGTCATCTACTCCCTCCGTCCCTAAATAACTGTCGCTTTCGCTTTCCAAAAAATAATTTTGATTATTTTTATATAAAAAAATGTTAATATTTTTG
ACACATAATTAATATCATTAGATAGTTCTTTTAATCTAGTTTTTTAACAAATTTATTTGGAGATACAAATGTTGCATGTTTTTTCTACAAATGGAGTCAA
ACTTGTGGCACGCACACCAACGGCGACACTTAAAAAGGGACAGAGGGAGTAGGTCCCTAAAC
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD osa-miRf11808-akr: 0.00005 microPC miR1439: 0.00005 | UniProt no hits RFAM MIR1122: 0.00006 | most similar mature miRNAs |
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