ABOUT THIS RECORDspecies: Panicum virgatum
miRNA family: miR3948
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Panicum virgatum Panicum Paniceae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA GGGAGTGGGAGTGGGAGTGGG miRNA* CGCCTCCGCCTCCGCCTCCCGC mismatches: 2 bulges: 1 |
pre-miRNA
TTCCAGCTCCCCATACTATTTTCCACCGCCTCCGCCTCCGCCTCCGCCTCCCGCCTACTCGGCCCCGCCGCAGTACGGATCCGAGCAGTATTACCGCCCC
AGTGGGTACTACTCTGCACCACTACCTCCACCTCAGTATGAGTACACCGGGGGACCCTCCGCACCGGTGGACTACAGCAGGCAGTATGAGCAGAGAGGGA
GGACCGGGGGTGGTGGTAGTGGGAGTGGGAGTGGGAGTGGGAGTGAGACTGGAAGGTATGGACTAGGCAC
dot-bracket secondary structure
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AGTGGGTACTACTCTGCACCACTACCTCCACCTCAGTATGAGTACACCGGGGGACCCTCCGCACCGGTGGACTACAGCAGGCAGTATGAGCAGAGAGGGA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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