ABOUT THIS RECORDspecies: Panicum virgatum
miRNA family: MIR1875
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Panicum virgatum Panicum Paniceae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA ACAATGGAGTGAGGTGCAACA miRNA* TTGCACCTTGCTCCGTTGTGG mismatches: 2 bulges: 0 |
pre-miRNA
GGCCTTATTTACTTGGGTAAATTTCACTCTGCCCCCTGCAGTTCAGCATGGTTTTGCTTTGCCGCTACGTTGTTCATTTCCATTGCACCTTGCTCCGTTG
TGGTATTGATGTTCTGCCGAAGGGAGTCCCTGTATCAAGGAATTGTTACATGGATGGCTGTTGACGTCGCCCATTGTCATGCATGGCACTGTGCCCACTA
GCATGATACGCTTGAACTATATGTTGCATTGCAGACGAATATAGATGCATCCACATTGTGGCAGTTATTTGATACAGAGACTTGCGACCCTAGACAAAAC
CACAATGGAGTGAGGTGCAACACAATGAACAATATTAATGTGGTAGCAAAGTGAAAGTCTGTCGAACTGCTGGGGACGAAGTGAATCTTTTCCAACAATT
T
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase osa-MIR1875: 0.00002 PMRD osa-miR1875: 0.00002 microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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